Работата на дестилационната колона изисква овладяване на материалния баланс, пари-течния баланс и топлинния баланс.
Материалният баланс се отнася до принципа, че количеството материал, влизащо в колоната за единица време, трябва да е равно на сумата от количествата материал, напускащи колоната. Материалният баланс отразява производствения капацитет на колоната и се регулира основно от скоростта на подаване и скоростите на изпускане на горната и долната част. По време на работа промените в материалния баланс се отразяват конкретно върху нивото на течността в долната част на колоната. Когато работата на колоната се отклони от общия материален баланс, това може да се отрази в промени в разликата в налягането в колоната. Например, ако повече материал влиза, отколкото излиза, разликата в налягането в колоната ще се увеличи.
За фиксирана дестилационна колона разликата в налягането в колоната трябва да бъде в определен диапазон. Ако разликата в налягането е твърде голяма, нарастващата скорост на парите в колоната е твърде висока, което води до силно увличане на мъгла и дори наводняване, което нарушава нормалната работа. Ако разликата в налягането е твърде малка, нарастващата скорост на парите в колоната е твърде ниска, което намалява ефекта на пренос на маса газ-течност върху тарелките и дори причинява изтичане, което значително намалява ефективността на тарелката. Лошият контрол на материалния баланс може да доведе до хаотична работа на цялата колона; овладяването на материалния баланс е решаващ аспект от работата на колоната. Ако нормалният материален баланс бъде нарушен, това ще засегне другите два баланса: балансът газ-течност няма да постигне очаквания ефект, а топлинният баланс също ще бъде нарушен и трябва да бъде коригиран отново.
